Molekularna dijagnostika i filogenetske osobitosti ENV gena virusa mačje imunodeficijencije u prirodno inficiranih mačaka u Republici Hrvatskoj

diplomski rad

• Naslov (engleski): Molecular Diagnostics and Phylogenetic Analysis of Feline Immunodeficiency Virus EVN Gene in Naturally Infected Cats in Croatia
• Autor: Valentina Kunić
• Mentor: Zrinka Štritof (mentor)
• Mentor: Matko Perharić (mentor)
• Član povjerenstva: Vilim Starešina (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Zrinka Štritof (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Matko Perharić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Veterinarski fakultet; (Zavod za mikrobiologiju i zarazne bolesti s klinikom); Zagreb
• Datum i država obrane: 2018-10-19, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO; Veterinarska medicina

Sažetak

Infekcija virusom mačje imunodeficijencije (FIV) retrovirusna je zarazna bolest
domaćih mačaka te predstavlja jedan od vodećih uzroka uginuća mačaka zarazne etiologije.
Bolest je proširena među populacijom domaćih mačaka diljem svijeta s visokom prevalencijom
u urbanim sredinama. Kao i ostali pripadnici roda Lentivirus, FIV uzrokuje perzistentnu
infekciju transkripcijom virusne ribonukleinske kiseline (RNK) u provirusnu
deoksiribonukleinsku kiselinu (DNK), te njezinom ugradnjm u genom domaćina. Upravo radi
sličnosti s virusom humane imunodeficijencije (HIV), FIV predstavlja istraživački model u
pronalasku učinkovitijeg liječenja i imunoprofilakse HIV-a. Obzirom da etiološko izliječenje
zaražene jedinke nije moguće provesti te da imunoprofilaksa ne zaštićuje mačke od filogenetski
različitih podtipova terenskih sojeva virusa, mjere opće profilakse predstavljaju najznačaniji
model u prevenciji i suzbijanju zaraze. Upravo je poznavanje filogenetskih karakteristika
terenskih sojeva virusa jedan od osnovnih preduvjeta razvoja učinkovitijih dijagnostičkih i
imunoprofilaktičnih mjera. Cilj ovog istraživanja bio je utvrditi perzistentnu infekciju virusom
mačje imunodeficijencije dokazom specifičnih nukleotidnih sljedova provirusnog env gena. Po
prvi puta na području Republike Hrvatske, infekcija je dokazana navedenom molekularnom
metodom dokazom env gena u 14 serološki FIV pozitivnih mačaka. Filogenetskim analizama
i usporedbama umnoženog odsječka provirusnog env gena FIV-a s nukleotidnim sljedovima
env gena iz genske banke, utvrđena je pripadnost svih 14 izolata s područja Republike Hrvatske
virusnom podtipu B. Pored pripadnosti B podtipu dokazana je i srodnost s izolatima bližeg
zemljopisnog područja. Većina nukleotidnih sljedova provirusnog env gena dobivenih ovim
istraživanjem najsrodnija je s izolatima virusa mačje imunodeficijencije s područja Austrije.
Iako svih 14 nukleotidnih sljedova provirusnog env gena pripada B podtipu, uočena je i njihova
međusobna heterogenost.

Sažetak (engleski)

Feline immunodeficiency virus (FIV) infection is a retroviral infectious disease of
domestic cats and is one of the leading causes of death of infectious etiology among cats. The
disease is spread among the population of domestic cats around the world with high prevalence
in urban areas. As other members of the genus Lentivirus, FIV causes persistent infection by
transcribing viral ribonucleic acid (RNK) into proviral deoxyribonucleic acid (DNA) and
incorporating it into the host genome. Because of its similarity with the human
immunodeficiency virus (HIV), FIV presents a valuable research model for finding more
effective treatment and HIV immunoprophylaxis. Given that etiologic treatment of the infected
individual is not possible to carry out and that the immunoprophylaxis does not protect the cats
from the phylogenetically different subtypes of field viral strains, general prophylactic
measures represent the most significant model for prevention and suppression of the infection.
Knowledge of the phylogenetic characteristics of field viral strains is one of the prerequisites
for the development of more effective diagnostic and immunoprophylactic measures. The aim
of this study was to determine the persistent infection from the feline immunodeficiency virus
by proving the specific nucleotide sequences of the provirus env gene. The persistent infection
was first proved in the Republic of Croatia in 14 FIV serologically positive cats by the stated
molecular method. Phylogenetic analyses of the multiplicated sequence of FIV proviral env
gene, along in comparison with the sequences of env gene from the gene bank, identified the
phylogenetic affiliation of all 14 isolates from the territory of the Republic of Croatia to the
viral subtype B. In addition to belonging to the viral B subtype, the isolates are phylogenetically
shown to correlate with the other isolates from the nearest geographic region. Most of the
nucleotide sequences obtained by this research show the most resemblance with the isolates of
the feline immunodeficiency virus from Austria. Although phylogenetically all 14 nucleotide
sequences of the proviral env gene belong to the B subtype, their mutual heterogeneity is also
observed.

• Ključne riječi: virus mačje imunodeficijencije; FIV; filogenetska analiza; B podtip; Hrvatska
• Ključne riječi (engleski): Feline immunodeficiency virus; FIV; phylogenetic analysis; subtype B; Croatia
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:178:248074
• Studijski program: Naziv: Veterinarska medicina; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: integrirani preddiplomski i diplomski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica veterinarske medicine (dr. med. vet.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2018-12-19 13:34:39